La historia se centra en Milla Maxwell, una joven sacerdotisa con el título de maestra de los espíritus. Cuando los espíritus comienzan a desaparecer en grandes cantidades, abandona su templo en Ni Akeria para encontrar el origen de la irregularidad. Frente a un laboratorio de Il Fahn, la ciudad de la noche, coincidirá con un estudiante de medicina llamado Jude Mathis, encuentro que cambiará el destino de ambos y el de la humanidad.